Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-D1P14427 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-D1P14427 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-D1P14427 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-D1P14427 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-D1P14427 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-D1P14427 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-D1P14427 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-D1P14427 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms