Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa1P11477 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa1P11477 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa1P11477 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa1P11477 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa1P11477 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa1P11477 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa1P11477 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa1P11477 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa1P11477 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa1P11477 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa1P11477 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa1P11477 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa1P11477 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa1P11477 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms