Protein–RNA interactions for Protein: P04344

Crygb, Gamma-crystallin B, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygbP04344 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrygbP04344 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CrygbP04344 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CrygbP04344 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrygbP04344 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrygbP04344 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrygbP04344 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrygbP04344 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrygbP04344 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CrygbP04344 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygbP04344 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygbP04344 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygbP04344 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrygbP04344 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygbP04344 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CrygbP04344 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrygbP04344 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrygbP04344 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrygbP04344 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrygbP04344 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrygbP04344 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrygbP04344 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrygbP04344 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrygbP04344 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrygbP04344 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrygbP04344 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrygbP04344 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrygbP04344 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms