Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tgfb1P04202 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgfb1P04202 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb1P04202 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb1P04202 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgfb1P04202 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfb1P04202 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgfb1P04202 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgfb1P04202 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms