Protein–RNA interactions for Protein: P03966

Mycn, N-myc proto-oncogene protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycnP03966 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MycnP03966 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MycnP03966 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MycnP03966 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MycnP03966 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MycnP03966 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MycnP03966 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MycnP03966 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MycnP03966 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MycnP03966 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MycnP03966 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MycnP03966 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MycnP03966 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MycnP03966 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MycnP03966 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MycnP03966 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MycnP03966 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MycnP03966 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MycnP03966 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MycnP03966 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MycnP03966 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MycnP03966 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MycnP03966 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MycnP03966 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MycnP03966 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MycnP03966 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MycnP03966 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MycnP03966 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MycnP03966 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MycnP03966 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MycnP03966 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MycnP03966 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MycnP03966 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MycnP03966 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MycnP03966 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MycnP03966 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MycnP03966 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MycnP03966 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MycnP03966 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MycnP03966 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MycnP03966 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MycnP03966 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MycnP03966 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MycnP03966 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MycnP03966 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MycnP03966 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MycnP03966 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MycnP03966 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MycnP03966 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MycnP03966 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MycnP03966 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MycnP03966 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MycnP03966 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MycnP03966 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MycnP03966 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MycnP03966 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MycnP03966 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MycnP03966 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MycnP03966 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MycnP03966 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MycnP03966 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MycnP03966 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MycnP03966 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MycnP03966 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MycnP03966 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MycnP03966 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MycnP03966 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MycnP03966 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MycnP03966 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MycnP03966 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MycnP03966 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MycnP03966 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MycnP03966 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MycnP03966 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MycnP03966 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MycnP03966 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MycnP03966 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MycnP03966 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MycnP03966 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MycnP03966 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MycnP03966 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MycnP03966 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MycnP03966 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MycnP03966 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MycnP03966 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MycnP03966 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MycnP03966 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MycnP03966 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MycnP03966 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MycnP03966 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MycnP03966 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MycnP03966 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MycnP03966 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MycnP03966 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MycnP03966 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MycnP03966 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MycnP03966 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MycnP03966 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MycnP03966 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MycnP03966 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms