Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01748 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01748 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01748 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01748 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01748 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01748 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01748 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01748 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01748 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01748 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01748 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01748 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01748 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01748 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01748 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01748 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01748 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01748 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01748 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01748 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01748 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01748 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01748 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01748 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01748 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01748 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01748 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01748 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01748 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01748 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01748 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01748 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01748 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01748 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01748 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01748 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01748 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01748 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01748 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01748 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01748 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01748 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01748 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01748 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01748 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01748 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01748 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01748 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01748 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01748 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01748 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01748 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01748 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01748 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01748 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01748 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01748 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01748 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01748 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01748 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01748 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01748 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01748 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01748 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01748 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P01748 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01748 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01748 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P01748 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01748 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01748 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01748 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01748 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01748 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01748 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01748 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01748 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01748 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01748 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01748 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01748 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01748 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01748 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01748 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01748 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01748 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01748 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01748 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01748 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01748 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01748 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01748 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01748 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01748 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01748 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01748 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01748 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01748 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01748 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms