Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3pxd2aO89032 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3pxd2aO89032 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3pxd2aO89032 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3pxd2aO89032 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3pxd2aO89032 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3pxd2aO89032 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3pxd2aO89032 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3pxd2aO89032 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3pxd2aO89032 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms