Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sema3fO88632 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sema3fO88632 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sema3fO88632 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sema3fO88632 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sema3fO88632 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sema3fO88632 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sema3fO88632 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sema3fO88632 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sema3fO88632 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sema3fO88632 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sema3fO88632 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sema3fO88632 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sema3fO88632 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sema3fO88632 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema3fO88632 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema3fO88632 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema3fO88632 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema3fO88632 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema3fO88632 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema3fO88632 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema3fO88632 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema3fO88632 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema3fO88632 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema3fO88632 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema3fO88632 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema3fO88632 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema3fO88632 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sema3fO88632 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sema3fO88632 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sema3fO88632 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema3fO88632 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Sema3fO88632 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema3fO88632 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms