Protein–RNA interactions for Protein: O88573

Aff1, AF4/FMR2 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff1O88573 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Aff1O88573 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Aff1O88573 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Aff1O88573 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aff1O88573 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Aff1O88573 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Aff1O88573 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Aff1O88573 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aff1O88573 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aff1O88573 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aff1O88573 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Aff1O88573 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Aff1O88573 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Aff1O88573 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aff1O88573 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aff1O88573 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Aff1O88573 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aff1O88573 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aff1O88573 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Aff1O88573 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Aff1O88573 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Aff1O88573 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Aff1O88573 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Aff1O88573 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Aff1O88573 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aff1O88573 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aff1O88573 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Aff1O88573 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aff1O88573 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aff1O88573 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Aff1O88573 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Aff1O88573 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Aff1O88573 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aff1O88573 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Aff1O88573 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Aff1O88573 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms