Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pja1O55176 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pja1O55176 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pja1O55176 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pja1O55176 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pja1O55176 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pja1O55176 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pja1O55176 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pja1O55176 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pja1O55176 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pja1O55176 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pja1O55176 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pja1O55176 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pja1O55176 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pja1O55176 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pja1O55176 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pja1O55176 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pja1O55176 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pja1O55176 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pja1O55176 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pja1O55176 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pja1O55176 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pja1O55176 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pja1O55176 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pja1O55176 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pja1O55176 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pja1O55176 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pja1O55176 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pja1O55176 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pja1O55176 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pja1O55176 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pja1O55176 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pja1O55176 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pja1O55176 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pja1O55176 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pja1O55176 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pja1O55176 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pja1O55176 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pja1O55176 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pja1O55176 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pja1O55176 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pja1O55176 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pja1O55176 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms