Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DffaO54786 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DffaO54786 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DffaO54786 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DffaO54786 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DffaO54786 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DffaO54786 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DffaO54786 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DffaO54786 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DffaO54786 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DffaO54786 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DffaO54786 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DffaO54786 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DffaO54786 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DffaO54786 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DffaO54786 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DffaO54786 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DffaO54786 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DffaO54786 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DffaO54786 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DffaO54786 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DffaO54786 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DffaO54786 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DffaO54786 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DffaO54786 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DffaO54786 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DffaO54786 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DffaO54786 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DffaO54786 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DffaO54786 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DffaO54786 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DffaO54786 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DffaO54786 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DffaO54786 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DffaO54786 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DffaO54786 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DffaO54786 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DffaO54786 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DffaO54786 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DffaO54786 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DffaO54786 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DffaO54786 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DffaO54786 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DffaO54786 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DffaO54786 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DffaO54786 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DffaO54786 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DffaO54786 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DffaO54786 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DffaO54786 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DffaO54786 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DffaO54786 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DffaO54786 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DffaO54786 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DffaO54786 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DffaO54786 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DffaO54786 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DffaO54786 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DffaO54786 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DffaO54786 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DffaO54786 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DffaO54786 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DffaO54786 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DffaO54786 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DffaO54786 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DffaO54786 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DffaO54786 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DffaO54786 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DffaO54786 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DffaO54786 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DffaO54786 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DffaO54786 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DffaO54786 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DffaO54786 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DffaO54786 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DffaO54786 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DffaO54786 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DffaO54786 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DffaO54786 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DffaO54786 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DffaO54786 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DffaO54786 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DffaO54786 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DffaO54786 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DffaO54786 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DffaO54786 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DffaO54786 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DffaO54786 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DffaO54786 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DffaO54786 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DffaO54786 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DffaO54786 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DffaO54786 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DffaO54786 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DffaO54786 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DffaO54786 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DffaO54786 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DffaO54786 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DffaO54786 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DffaO54786 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms