Protein–RNA interactions for Protein: O35929

Rem1, GTP-binding protein REM 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rem1O35929 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rem1O35929 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rem1O35929 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rem1O35929 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rem1O35929 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rem1O35929 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rem1O35929 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rem1O35929 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rem1O35929 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rem1O35929 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rem1O35929 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rem1O35929 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rem1O35929 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rem1O35929 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rem1O35929 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rem1O35929 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rem1O35929 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rem1O35929 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rem1O35929 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rem1O35929 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rem1O35929 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rem1O35929 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rem1O35929 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rem1O35929 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rem1O35929 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rem1O35929 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rem1O35929 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rem1O35929 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rem1O35929 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rem1O35929 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rem1O35929 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rem1O35929 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms