Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd2O35392 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxd2O35392 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxd2O35392 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd2O35392 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd2O35392 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd2O35392 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms