Protein–RNA interactions for Protein: O35199

Vmn2r89, Putative pheromone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r89O35199 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r89O35199 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r89O35199 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r89O35199 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r89O35199 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r89O35199 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms