Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hdac1O09106 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac1O09106 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hdac1O09106 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hdac1O09106 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hdac1O09106 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Hdac1O09106 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hdac1O09106 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hdac1O09106 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hdac1O09106 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hdac1O09106 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hdac1O09106 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hdac1O09106 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hdac1O09106 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hdac1O09106 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hdac1O09106 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hdac1O09106 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hdac1O09106 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hdac1O09106 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms