Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ube3aO08759 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3aO08759 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ube3aO08759 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube3aO08759 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3aO08759 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3aO08759 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3aO08759 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3aO08759 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube3aO08759 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3aO08759 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3aO08759 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3aO08759 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube3aO08759 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ube3aO08759 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms