Protein–RNA interactions for Protein: O08746

Matn2, Matrilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn2O08746 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Matn2O08746 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Matn2O08746 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Matn2O08746 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Matn2O08746 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Matn2O08746 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Matn2O08746 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Matn2O08746 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Matn2O08746 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Matn2O08746 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Matn2O08746 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn2O08746 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Matn2O08746 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Matn2O08746 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Matn2O08746 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Matn2O08746 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Matn2O08746 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Matn2O08746 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Matn2O08746 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Matn2O08746 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Matn2O08746 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Matn2O08746 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Matn2O08746 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Matn2O08746 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Matn2O08746 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Matn2O08746 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Matn2O08746 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Matn2O08746 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Matn2O08746 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn2O08746 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn2O08746 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Matn2O08746 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Matn2O08746 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Matn2O08746 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Matn2O08746 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Matn2O08746 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Matn2O08746 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Matn2O08746 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Matn2O08746 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Matn2O08746 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms