Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm2888K7N746 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm2888K7N746 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm2888K7N746 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm2888K7N746 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm2888K7N746 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm2888K7N746 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm2888K7N746 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm2888K7N746 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm2888K7N746 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm2888K7N746 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm2888K7N746 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm2888K7N746 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm2888K7N746 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm2888K7N746 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm2888K7N746 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm2888K7N746 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm2888K7N746 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm2888K7N746 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm2888K7N746 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm2888K7N746 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm2888K7N746 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm2888K7N746 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm2888K7N746 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm2888K7N746 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm2888K7N746 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm2888K7N746 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm2888K7N746 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms