Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm21969J3QJZ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm21969J3QJZ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm21969J3QJZ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm21969J3QJZ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm21969J3QJZ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gm21969J3QJZ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm21969J3QJZ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm21969J3QJZ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm21969J3QJZ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms