Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn34c3J3QJW5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34c3J3QJW5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c3J3QJW5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn34c3J3QJW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34c3J3QJW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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