Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp408H7BX78 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp408H7BX78 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp408H7BX78 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp408H7BX78 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfp408H7BX78 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp408H7BX78 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp408H7BX78 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp408H7BX78 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp408H7BX78 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zfp408H7BX78 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp408H7BX78 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zfp408H7BX78 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfp408H7BX78 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp408H7BX78 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms