Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf4bG5E8Z2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf4bG5E8Z2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf4bG5E8Z2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Taf4bG5E8Z2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Taf4bG5E8Z2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Taf4bG5E8Z2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms