Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tubgcp6G5E8P0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tubgcp6G5E8P0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tubgcp6G5E8P0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tubgcp6G5E8P0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tubgcp6G5E8P0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tubgcp6G5E8P0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tubgcp6G5E8P0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tubgcp6G5E8P0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tubgcp6G5E8P0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Tubgcp6G5E8P0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tubgcp6G5E8P0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Tubgcp6G5E8P0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tubgcp6G5E8P0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms