Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Usp17lcG5E8I7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp17lcG5E8I7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp17lcG5E8I7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17lcG5E8I7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17lcG5E8I7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17lcG5E8I7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp17lcG5E8I7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp17lcG5E8I7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp17lcG5E8I7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp17lcG5E8I7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp17lcG5E8I7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp17lcG5E8I7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp17lcG5E8I7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
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