Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Usp17ldG5E8G2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp17ldG5E8G2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp17ldG5E8G2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17ldG5E8G2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17ldG5E8G2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp17ldG5E8G2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp17ldG5E8G2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp17ldG5E8G2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp17ldG5E8G2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp17ldG5E8G2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp17ldG5E8G2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp17ldG5E8G2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp17ldG5E8G2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms