Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sclt1G5E861 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sclt1G5E861 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sclt1G5E861 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sclt1G5E861 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sclt1G5E861 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sclt1G5E861 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms