Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b1G5E829 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b1G5E829 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp2b1G5E829 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp2b1G5E829 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b1G5E829 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b1G5E829 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp2b1G5E829 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2b1G5E829 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp2b1G5E829 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms