Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h12bG3X9I7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h12bG3X9I7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h12bG3X9I7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h12bG3X9I7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zc3h12bG3X9I7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h12bG3X9I7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zc3h12bG3X9I7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zc3h12bG3X9I7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zc3h12bG3X9I7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zc3h12bG3X9I7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zc3h12bG3X9I7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zc3h12bG3X9I7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h12bG3X9I7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms