Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm5861F6VCN9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5861F6VCN9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5861F6VCN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5861F6VCN9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms