Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Plekhg1F6S200 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Plekhg1F6S200 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Plekhg1F6S200 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Plekhg1F6S200 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Plekhg1F6S200 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Plekhg1F6S200 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Plekhg1F6S200 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Plekhg1F6S200 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Plekhg1F6S200 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Plekhg1F6S200 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Plekhg1F6S200 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Plekhg1F6S200 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Plekhg1F6S200 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Plekhg1F6S200 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Plekhg1F6S200 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Plekhg1F6S200 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Plekhg1F6S200 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Plekhg1F6S200 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Plekhg1F6S200 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Plekhg1F6S200 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Plekhg1F6S200 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Plekhg1F6S200 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Plekhg1F6S200 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Plekhg1F6S200 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Plekhg1F6S200 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Plekhg1F6S200 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Plekhg1F6S200 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Plekhg1F6S200 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Plekhg1F6S200 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Plekhg1F6S200 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Plekhg1F6S200 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Plekhg1F6S200 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Plekhg1F6S200 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Plekhg1F6S200 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Plekhg1F6S200 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Plekhg1F6S200 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Plekhg1F6S200 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Plekhg1F6S200 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Plekhg1F6S200 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms