Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf165E9QAU8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf165E9QAU8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf165E9QAU8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf165E9QAU8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf165E9QAU8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf165E9QAU8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf165E9QAU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf165E9QAU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf165E9QAU8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf165E9QAU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf165E9QAU8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf165E9QAU8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf165E9QAU8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf165E9QAU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf165E9QAU8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms