Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Phldb3E9QAF4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phldb3E9QAF4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phldb3E9QAF4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phldb3E9QAF4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phldb3E9QAF4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Phldb3E9QAF4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phldb3E9QAF4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phldb3E9QAF4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phldb3E9QAF4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phldb3E9QAF4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phldb3E9QAF4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Phldb3E9QAF4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phldb3E9QAF4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phldb3E9QAF4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Phldb3E9QAF4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms