Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9G1

1700080E11Rik, RIKEN cDNA 1700080E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700080E11RikE9Q9G1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1700080E11RikE9Q9G1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700080E11RikE9Q9G1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
1700080E11RikE9Q9G1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700080E11RikE9Q9G1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700080E11RikE9Q9G1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700080E11RikE9Q9G1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms