Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
4930579F01RikE9Q3L6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930579F01RikE9Q3L6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930579F01RikE9Q3L6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms