Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn1r68E9Q0V3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r68E9Q0V3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r68E9Q0V3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r68E9Q0V3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms