Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsph10bE9PYQ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rsph10bE9PYQ0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rsph10bE9PYQ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rsph10bE9PYQ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rsph10bE9PYQ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms