Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc144bE9PVZ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc144bE9PVZ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc144bE9PVZ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc144bE9PVZ3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc144bE9PVZ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc144bE9PVZ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms