Protein–RNA interactions for Protein: E9PUZ0

Apol11b, Apolipoprotein L 11b, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol11bE9PUZ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apol11bE9PUZ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apol11bE9PUZ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apol11bE9PUZ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apol11bE9PUZ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol11bE9PUZ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol11bE9PUZ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms