Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp839E9PUU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zfp839E9PUU5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfp839E9PUU5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp839E9PUU5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp839E9PUU5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp839E9PUU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp839E9PUU5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms