Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc170D3YXL0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc170D3YXL0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc170D3YXL0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc170D3YXL0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc170D3YXL0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms