Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smok3bC0HKC9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smok3bC0HKC9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smok3bC0HKC9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smok3bC0HKC9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smok3bC0HKC9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smok3bC0HKC9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.7 ms