Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CatipB9EKE5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CatipB9EKE5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CatipB9EKE5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CatipB9EKE5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CatipB9EKE5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CatipB9EKE5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CatipB9EKE5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CatipB9EKE5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CatipB9EKE5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CatipB9EKE5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CatipB9EKE5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CatipB9EKE5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CatipB9EKE5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CatipB9EKE5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CatipB9EKE5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CatipB9EKE5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CatipB9EKE5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CatipB9EKE5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CatipB9EKE5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CatipB9EKE5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CatipB9EKE5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CatipB9EKE5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CatipB9EKE5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CatipB9EKE5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CatipB9EKE5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CatipB9EKE5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CatipB9EKE5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CatipB9EKE5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CatipB9EKE5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CatipB9EKE5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CatipB9EKE5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CatipB9EKE5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CatipB9EKE5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CatipB9EKE5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CatipB9EKE5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CatipB9EKE5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CatipB9EKE5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CatipB9EKE5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CatipB9EKE5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CatipB9EKE5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms