Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf11bB4XVQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf11bB4XVQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf11bB4XVQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf11bB4XVQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf11bB4XVQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf11bB4XVQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf11bB4XVQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf11bB4XVQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf11bB4XVQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf11bB4XVQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf11bB4XVQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf11bB4XVQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf11bB4XVQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf11bB4XVQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf11bB4XVQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf11bB4XVQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf11bB4XVQ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf11bB4XVQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf11bB4XVQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf11bB4XVQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms