Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cspp1B2RX88 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cspp1B2RX88 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cspp1B2RX88 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cspp1B2RX88 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cspp1B2RX88 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cspp1B2RX88 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cspp1B2RX88 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cspp1B2RX88 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cspp1B2RX88 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cspp1B2RX88 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cspp1B2RX88 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cspp1B2RX88 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cspp1B2RX88 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms