Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Mbd5B1AYB6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Mbd5B1AYB6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Mbd5B1AYB6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Mbd5B1AYB6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Mbd5B1AYB6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Mbd5B1AYB6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Mbd5B1AYB6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Mbd5B1AYB6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Mbd5B1AYB6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Mbd5B1AYB6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Mbd5B1AYB6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Mbd5B1AYB6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Mbd5B1AYB6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Mbd5B1AYB6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Mbd5B1AYB6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Mbd5B1AYB6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Mbd5B1AYB6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Mbd5B1AYB6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Mbd5B1AYB6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Mbd5B1AYB6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Mbd5B1AYB6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Mbd5B1AYB6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Mbd5B1AYB6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Mbd5B1AYB6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Mbd5B1AYB6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Mbd5B1AYB6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Mbd5B1AYB6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Mbd5B1AYB6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Mbd5B1AYB6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Mbd5B1AYB6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Mbd5B1AYB6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Mbd5B1AYB6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Mbd5B1AYB6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Mbd5B1AYB6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Mbd5B1AYB6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Mbd5B1AYB6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Mbd5B1AYB6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Mbd5B1AYB6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Mbd5B1AYB6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Mbd5B1AYB6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Mbd5B1AYB6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Mbd5B1AYB6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms