Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Spocd1B1ASB6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Spocd1B1ASB6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spocd1B1ASB6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spocd1B1ASB6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Spocd1B1ASB6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spocd1B1ASB6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spocd1B1ASB6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Spocd1B1ASB6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spocd1B1ASB6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spocd1B1ASB6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Spocd1B1ASB6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spocd1B1ASB6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spocd1B1ASB6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Spocd1B1ASB6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Spocd1B1ASB6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spocd1B1ASB6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms