Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skint2A7XUX6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skint2A7XUX6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skint2A7XUX6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skint2A7XUX6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms