Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp4A4UUI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbp4A4UUI3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp4A4UUI3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp4A4UUI3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp4A4UUI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms