Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf39A2RT81 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf39A2RT81 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf39A2RT81 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf39A2RT81 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf39A2RT81 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf39A2RT81 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf39A2RT81 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf39A2RT81 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf39A2RT81 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf39A2RT81 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms