Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttll9A2APC3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttll9A2APC3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll9A2APC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttll9A2APC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttll9A2APC3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttll9A2APC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms